Interdisziplinärer Beitrag zur Optimierung dynamischer Modelle biochemischer Netzwerke

Projektlaufzeit

01.07.2013. - 10.12.2013.

Im Projekt einbezogenen Länder und Institutionen

flag-LV
Universität für Landwirtschaft Lettlands
flag-DE
Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg
flag-LV
Universität Lettlands

Ziel des Projekts

  • Weiterentwicklung der interdisziplinären Zusammenarbeit der Spezialisten mit biologischem und mathematischem Hintergrund bei der Optimierung biochemischer Netzwerke,
  • Entwicklung der Zusammenarbeit zwischen Biologen und Softwareentwicklern
  • Verbesserung der Sichtbarkeit der interdisziplinären Zusammenarbeit bei Studierenden auf internationaler Ebene,
  • Erfassung der Eigenschaften von in dem Programm COPASI implementierten Optimierungsmethoden,
  • Erstellung von rationalen Empfehlungen für die Auswahl von Optimierungsmethoden für dynamische Modelle  biochemischer Netzwerke.

Hauptaktivitäten des Projekts

  1. Erfahrungsaustausch und Abschluss einer Vereinbarung über den Verlauf der numerischen Experimente.
  2. Seminar „Möglichkeiten der Optimierung dynamischer biochemischer Modelle“.
  3. Optimierungsexperimente
  4. Seminar „Algorithmen für die Optimierung dynamischer biochemischer Modelle“

Die erreichte Projektzielgruppe und deren Umfang

Teilnehmer der interdisziplinär ausgerichteten Systembiologie: Biologen, Biotechnologen und Informatiker. In Seminaren wurden 31 Leute direkt angesprochen. Unbekanntes Anzahl ist durch Internet erreicht.